Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms