Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFHD1Q9BUP0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms