Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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KCNS3Q9BQ31 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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