Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms