Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms