Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZC2HC1AQ96GY0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms