Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms