Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF21BQ96EK2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms