Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms