Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms