Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms