Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms