Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms