Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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