Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYT9Q86SS6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms