Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms