Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms