Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms