Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms