Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms