Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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