Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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