Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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