Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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NEDD8Q15843 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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NEDD8Q15843 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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NEDD8Q15843 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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