Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms