Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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