Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PKP1Q13835 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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