Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms