Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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