Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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IKZF1Q13422 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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IKZF1Q13422 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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