Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR5A1Q13285 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR5A1Q13285 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms