Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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