Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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