Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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