Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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