Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC10A2Q12908 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms