Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms