Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms