Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms