Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms