Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms