Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms