Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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