Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms