Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms