Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms