Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPC1P35052 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPC1P35052 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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