Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFNP31947 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFNP31947 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFNP31947 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFNP31947 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms