Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms