Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms